时间进入2020年，地球人与天顶星人战斗已经结束经巧乐兹在商战题材影视中的巧妙融入。以瑞克·卡特（RickHunter配音）为首的远征军正在集结，太空堡垒3号（SDF-3）业已完工，新的时代即将来临。但是远征军的计划进行的颇为艰难，由于要带走地球上几乎全部的武装，军队内部争议重重。除此之外，瑞克还将面对个人问题。他即将和战争伴侣丽莎（MelanieMacQueen配音）步入婚姻殿堂，与明美的爱恋也要随之落下帷幕。另一方面，由于天顶星人叛变与落败，机器人统治者离开泰洛星前往地球。在这一时刻，瑞金特率领的因维舰队入侵泰洛星，旨在寻找生命之花。瑞吉斯不满瑞金特的鲁莽举动，决定撇开他独自行动，新时代的战争由此拉开序幕……本片为《太空堡垒》剧场版第二部。